Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo43Q8CDI2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxo43Q8CDI2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms