Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CrebrfQ8CDG5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CrebrfQ8CDG5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CrebrfQ8CDG5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CrebrfQ8CDG5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CrebrfQ8CDG5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CrebrfQ8CDG5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms