Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcinQ8CDE2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms