Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms