Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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