Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynpoQ8CC35 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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