Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb2Q8CC27 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms