Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm16223Q8CBM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16223Q8CBM3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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