Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms