Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms