Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A430089I19RikQ8C9W1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms