Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms