Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dclre1bQ8C7W7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms