Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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