Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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