Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska3Q8C263 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska3Q8C263 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms