Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X7

Slco6c1, Solute carrier organic anion transporter family, member 6c1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6c1Q8C0X7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco6c1Q8C0X7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco6c1Q8C0X7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms