Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpcpd1Q8C0L9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpcpd1Q8C0L9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms