Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Usp47Q8BY87 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Usp47Q8BY87 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Usp47Q8BY87 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Usp47Q8BY87 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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