Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms