Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms