Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms