Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms