Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms