Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms