Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Best2Q8BGM5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms