Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmtc4Q8BG19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmtc4Q8BG19 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmtc4Q8BG19 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmtc4Q8BG19 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmtc4Q8BG19 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms