Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ChfrQ810L3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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ChfrQ810L3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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ChfrQ810L3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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ChfrQ810L3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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ChfrQ810L3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms