Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms