Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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