Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms