Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms