Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ell3Q80VR2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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