Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms