Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnma8aQ80VM8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms