Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc29Q80VM3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ttc29Q80VM3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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