Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf8Q80TJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms