Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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