Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms