Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcl2Q78Y63 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms