Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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