Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms