Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GypcQ78HU7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms