Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms