Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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