Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms