Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms