Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms