Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80Q6ZPV2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms