Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms